MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI02

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021495	A	6	6	555	560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021495	TCA	3	9	1306	1314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021495	GTA	2	6	1344	1349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021495	C	6	6	1395	1400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_021495	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021495	T	8	8	2207	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021495	TC	3	6	2277	2282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_021495	AGT	2	6	2366	2371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021495	TAT	2	6	2373	2378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021495	CT	4	8	2421	2428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_021495	CTT	2	6	2484	2489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021495	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021495	TTTTC	2	10	2567	2576	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021495	TAT	2	6	2615	2620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021495	TATG	2	8	3270	3277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021495	TAT	2	6	3290	3295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021495	ATAA	2	8	3351	3358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021495	A	6	6	3485	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021495	CAA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021495	CTTT	2	8	3992	3999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021495	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021495	T	7	7	4056	4062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021495	CG	3	6	4071	4076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021495	T	6	6	4095	4100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021495	TG	3	6	4106	4111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021495	TGG	2	6	4162	4167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021495	TATT	2	8	4206	4213	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021495	ATA	2	6	4262	4267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021495	AT	4	8	4273	4280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021495	GGA	2	6	4295	4300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021495	AAG	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021495	TA	3	6	5370	5375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021495	CTA	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021495	TCC	2	6	6843	6848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_021495	ATAG	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021495	CTAT	2	8	6860	6867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021495	A	7	7	6878	6884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021495	T	6	6	7278	7283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021495	AAGC	2	8	7316	7323	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021495	CGT	2	6	7345	7350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021495	GAA	2	6	7423	7428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021495	TTC	2	6	8783	8788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021495	AT	3	6	8795	8800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021495	TAA	3	9	8998	9006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021495	A	6	6	9040	9045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021495	TCA	2	6	11192	11197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021495	TA	3	6	11200	11205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021495	TAA	2	6	11344	11349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021495	TTAAT	2	10	11353	11362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021495	T	6	6	11396	11401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021495	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021495	CAT	2	6	11468	11473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021495	CAA	2	6	11474	11479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021495	AT	3	6	12563	12568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021495	AACCT	2	10	12658	12667	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021495	GCG	2	6	13196	13201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021495	GGA	2	6	13243	13248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021495	T	6	6	13291	13296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021495	C	6	6	13889	13894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_021495	TAA	2	6	13913	13918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021495	A	6	6	13917	13922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021495	AATA	2	8	13983	13990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021495	ATTA	2	8	15448	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021495	T	7	7	15497	15503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021495	ATA	2	6	15537	15542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021495	AGG	2	6	15566	15571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.